蘚苔類 46種
ミズゴケ科 2種
オオミズゴケ Sphagnum palustre L. 宮崎県レッドデータ（2020改正）準絶滅危惧（NT-ｒ）
ウロコミズゴケ Sphagnum squarrosum Crome
キセルゴケ科 1種
イクビゴケ Diphyscium fulvifolium Mitt.
スギゴケ科 4種
コスギゴケ Pogonatum inflexum (Lindb.) Sande Lac.
コセイタカスギゴケ Pogonatum contortum (Brid.) Lesq.
ハミズゴケ Pogonatum spinulosum Mitt.
ウマスギゴケ Polytrichum commune L. ex Hedw.
ホウオウゴケ科 2種
サクラジマホウオウゴケ Fissidens crispulus Brid.
トサカホウオウゴケ Fissidens dubius P.Beauv.
シッポゴケ科 2種
ススキゴケ Dicranella heteromalla (Hedw.) Schimp.
チヂミバコブゴケ Oncophorus crispifolius (Mitt.) Lindb.
シラガゴケ科 2種
ホソバオキナゴケ Leucobryum juniperoideum (Brid.) M_ll.Hal.
オオシラガゴケ Leucobryum scabrum Sande Lac.
センボンゴケ科 1種
ナメリオウムゴケ Gymnostomum aurantiacum (Mitt.) Paris
ギボウシゴケ科 1種
ハチヂレゴケ Ptychomitrium dentatum (Mitt.) A.Jaeger
ハリガネゴケ科 2種
ツクシハリガネゴケ Rosulabryum billardieri (Schw_gr.) J.R.Spruce
オオカサゴケ Rhodobryum giganteum (Schw_gr.) Paris
チョウチンゴケ科 1種
エゾチョウチンゴケ Trachycystis flagellaris (Sull. et Lesq.) Lindb.
タマゴケ科 1種
タマゴケ Bartramia pomiformis Hedw.
コウヤノマンネングサ科 1種
コウヤノマンネングサ Climacium japonicum Lindb.
イトヒバゴケ科 1種
ツルゴケ Pilotrichopsis dentata (Mitt.) Besch.
イタチゴケ科 1種
トガリイタチゴケ Leucodon nipponicus Nog.
ヒムロゴケ科 2種
ヒムロゴケ Pterobryon arbuscula Mitt.
フクラゴケ Eumyurium sinicum (Mitt.) Nog.
ハイヒモゴケ科 1種
キヨスミイトゴケ Barbella flagellifera (Cardot) Nog.
ヒラゴケ科 1種
キダチヒラゴケ Homaliodendron flabellatum (Sm.) M.Fleisch.
アブラゴケ科 1種
アブラゴケ Hookeria acutifolia Hook. et Grev.
シノブゴケ科 3種
コバノイトゴケ Haplohymenium pseudotriste (M_ll.Hal.) Broth.
ナガスジイトゴケ Haplohymenium longinerve (Broth.) Broth.
チャボシノブゴケ Pelekium versicolor (Hornsch. ex M_ll.Hal.) Touw
ハイゴケ科 3種
シロイチイゴケ Isopterygium albescens (Hook.) A.Jaeger
イトハイゴケ Hypnum tristoviride (Broth.) Paris
キノウエノコハイゴケ Hypnum pallescens (Hedw.) P.Beauv.
イワダレゴケ科 1種
コフサゴケ Rhytidiadelphus japonicus (Reimers) T.J.Kop.
コマチゴケ科 1種
コマチゴケ Haplomitrium mnioides (Lindb.) R.M.Schust.
ムクムクゴケ科 1種
ムクムクゴケ Trichocolea tomentella (Ehrh.) Dumort.
ムチゴケ科 1種
コムチゴケ Bazzania tridens (Reinw., Blume et Nees) Trevis.
ヤバネゴケ科 1種
フクロヤバネゴケ Nowellia curvifolia (Dicks.) Mitt.
ツボミゴケ科 1種
オヤコゴケ Schistochilopsis cornuta (Steph.) Konstant.
ハネゴケ科 1種
マルバハネゴケ Plagiochila ovalifolia Mitt.
サワラゴケ科 1種
イヌムクムクゴケ Trichocoleopsis sacculata (Mitt.) S.Okamura
クサリゴケ科 1種
ケシゲリゴケ Nipponolejeunea pilifera (Steph.) S.Hatt.
ミズゼニゴケ科 1種
ホソバミズゼニゴケ Apopellia endiviifolia (Dicks.) Nebel et D.Quandt
マキノゴケ科 1種
マキノゴケ Makinoa crispata (Steph.) Miyake
フタマタゴケ科 1種
コモチフタマタゴケ Metzgeria temperata Kuwah.
ジャゴケ科 1種
ジャゴケ Conocephalum conicum (L.) Dumort.
